Profesor Nagasaki i profesor Kawaguchi z Centrum Medycyny Genomowej, w podyplomowej szkole medycyny na Uniwersytecie w Kioto

Wysokiej wydajności model TS-2483XU-RP pozwala przyspieszyć i usprawnić analizę danych genomowych.

  • Informacje podstawowe

    Profesor Nagasaki i profesor Kawaguchi z Centrum Medycyny Genomowej, w podyplomowej szkole medycyny na Uniwersytecie w Kioto prowadzą badaniami nad genomami, metabolitami i studiują informacje o zdrowiu w poszukiwaniu czynników chorobotwórczych u ludzi, co stanowi ich główny cel. Przeprowadzają wielkoskalową analizę danych dziesiątek tysięcy osób.

  • Wyzwania

    Genom składa się z 3 miliardów par zasad (3 GB) na osobę, a podczas analizy genomu przetwarzana jest ogromna ilość danych. Dlatego potrzebna była wysokowydajna pamięć masowa. Wcześniej profesorowie, aby pomieścić wszystkie dane, korzystali z pamięci masowej RAID podłączonej bezpośrednio do każdego serwera obliczeniowego jako pamięci masowej typu near-line na terenie uczelni. W przypadku tej metody wąskim gardłem była szybkość operacji, a dane były dosłownie rozrzucone pomiędzy kilkunastoma urządzeniami pamięci masowej, co utrudniało badaczom korzystanie z nich.

Rozwiązanie

Naukowcy zainstalowali trzy urządzenia TS-2483XU-RP firmy QNAP, aby uzyskać wysoką szybkość operacji we/wy, efektywność kosztową i łatwiejsze przenoszenie (gdy wymagane jest fizyczne przeniesienie serwera NAS). Co więcej, mają zapewniony dostęp do części nawet po zakończeniu okresu gwarancyjnego. TS-2483XU-RP to wysoko wydajny, 24-wnękowy serwer NAS, wyposażony w procesory Intel ® Xeon® E i pamięć DDR4 ECC o pojemności do 128 GB oraz dwa porty 10GbE SFP+. Badacze zainstalowali również inne rozproszone pamięci masowe o wysokiej szybkości, a następnie zintegrowali je z pamięcią masową typu near-line obejmującą serwer QNAP NAS, aby oddzielnie przechowywać dane w zależności od ich przeznaczenia. Dane analityczne są przechowywane w najszybszej pamięci masowej, a dane podstawowe są przechowywane jako zimne dane, ponieważ są one niezbędne, ale rzadko wymagają dostępu.

Wyniki

Profesorowie otrzymali kompleksowy pakiet pamięci masowej QNAP, co pozwoliło im znacznie obniżyć koszty wdrażania i zarządzania dzięki scentralizowanemu interfejsowi do zarządzania i konfiguracji opartej na interfejsie graficznym. Łatwy w instalacji serwer QNAP NAS stał się niezastąpiony do wymiany danych z instytucjami zewnętrznymi. Dodatkowo scentralizowany dostęp do danych umożliwił zwiększenie wygody użytkowników oraz zbudowanie ekonomicznego systemu pamięci masowej, spełniającego wymogi w zakresie operacji we/wy. Profesorowie tworzą aktualnie środowisko chmury hybrydowej, które łączy w sobie trzy infrastruktury: serwery fizyczne, chmury publiczne oraz interdyscyplinarną infrastrukturę obliczeniową wysokiej wydajności (superkomputery) w akademickiej sieci informatycznej SINET*. Serwer QNAP NAS służy nie tylko jako pierwotnie przewidziana pamięć masowa typu near-line, ale też jako bezpośrednie środowisko operacji we/wy z klastrów komputerowych. W przyszłości profesorowie chcieliby stworzyć bardziej spójne środowisko, w którym scentralizowane będą dane ze wszystkich platform, a użytkownicy będą mogli korzystać z żądanych danych bez wnikania w różnice między platformami i aplikacjami.

*SINET to infrastruktura akademickiej sieci informatycznej przeznaczona dla japońskich uniwersytetów i instytutów badawczych.

Wybierz specyfikację

      Więcej Mniej

      Ta strona dostępna jest w też krajach/regionach:

      open menu
      back to top