Profesor Nagasaki a profesor Kawaguči z Centra pro genomickou medicínu, Postgraduální lékařská fakulta, Kjótská univerzita

Vysoce výkonné zařízení TS-2483XU-RP urychluje a zefektivňuje analýzu genomových dat.

  • Situace

    Profesor Nagasaki a profesor Kawaguči z Centra pro genomickou medicínu na Postgraduální lékařské fakultě Kjótské univerzity studují genomy, metabolity a informace o zdraví, přičemž jejich hlavním cílem je hledání faktorů souvisejících s nemocemi u lidí. Provádějí rozsáhlou analýzu dat desítek tisíc lidí.

  • Problémy

    Genom tvoří 3 miliardy párů bází (3 GB) na osobu a při analýze genomu je třeba zpracovat extrémní množství dat. Proto bylo zapotřebí vysoce výkonné úložiště. Profesoři dříve používali úložiště RAID přímo připojené ke každému výpočetnímu serveru jako lokální úložiště near-line, kam se ukládala všechna data. Při této metodě byla problematická rychlost I/O a data byla doslova rozptýlena v několika úložných jednotkách, což výzkumníkům ztěžovalo jejich využití.

Řešení

Profesoři nainstalovali tři zařízení QNAP TS-2483XU-RP kvůli vysoké rychlosti I/O s pozáruční dostupností dílů, efektivitě nákladů a snadnější přenositelnosti (když potřebují NAS fyzicky přemístit). TS-2483XU-RP je vysoce výkonný 24pozicový NAS s procesory Intel ® Xeon® E, až 128 GB paměti DDR4 ECC a dvěma porty 10GbE SFP+. Profesoři také nainstalovali další vysokorychlostní distribuované úložiště a integrovali je s úložištěm near-line, které se skládá z QNAP NAS, aby bylo možné ukládat data odděleně podle jejich účelu. Analytická data se ukládají na nejrychlejším úložišti a základní data se ukládají jako chladná data, která jsou nezbytná, ale přistupuje se k nim jen zřídka.

Výsledky

Profesoři získali kompletní sadu úložišť QNAP, která jim umožňuje výrazně snížit náklady na učení i správu díky centralizovanému rozhraní pro správu a konfiguraci pomocí grafického uživatelského rozhraní. Zařízení QNAP NAS se snadno instaluje a stalo se nepostradatelným médiem pro výměnu dat s externími institucemi. Umožnilo jim to zvýšit uživatelský komfort díky centralizovanému přístupu k datům a vytvořit nákladově efektivní systém úložiště, který splňuje požadavky na vstupy a výstupy. Páni profesoři budují hybridní cloudové prostředí, které kombinuje tři infrastruktury: lokální servery, veřejné cloudy a mezioborovou infrastrukturu pro vysoce výkonné výpočty (tzv. superpočítače) v akademické informační síti SINET*. Nejen jako původně zamýšlené úložiště near-line, ale profesoři používají QNAP NAS také jako prostředí pro přímé I/O z počítačových clusterů. V budoucnu chtějí profesoři vytvořit jednotnější prostředí, v němž budou data jednotlivých platforem centralizována a uživatelé budou moci využívat požadovaná data, aniž by byly patrné rozdíly mezi platformami a aplikacemi.

*SINET je akademická síťová infrastruktura IT pro japonské univerzity a výzkumné ústavy.

Zvolte specifikaci

      Zobrazit více Zobrazit méně

      Tato stránka v jiných zemích / oblastech:

      open menu
      back to top